等位基因(英语：allele)，是染色体内的基因座的可以复制的DNA序列，其在细胞有丝分裂时的染色体上的两个基因座是对应排列的，等位基因故在早期细胞遗传学里称其为等位。

　　等位基因

　　一个生物体里，某个基因的基因型是由该基因所拥有的一对等位基因所决定。例如在人和其他二倍体生物，也就是每条染色体都有两套的生物，其等位基因的两个位点决定了该基因的基因型。等位基因两个位点来自父辈和母辈的遗传，其基因型决定了生物的表现型。 生物的表现型由一对等位基因的一个位点决定的，称显性基因;而由两个位点决定的，则称为隐性基因。例如等位基因一个位点的突变，可产生癌基因，而两个位点的突变或丢失，则可导致肿瘤抑制基因，或抑癌基因的突变。这些基因的改变是肿瘤发生的分子基础。

　　如何理解?

　　高中学生物的时候关于遗传学的部分，记得当时的教材上为了简化处理一般将基因型定义为AA, Aa, aa。其实这种抽象的理解对应付高考是很有用的，但是实际应用中如果还这样理解那么便会产生一些疑问。之所以会产生这样的抽象，原因是早期并不知道双螺旋DNA是遗传物质，就更不提什么中心法则和DNA测序了。然而当时非常有慧根的孟德尔先生他通过豌豆杂交