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MiSeq FGx法医专用系统用于单亲亲缘关系分析判定
版块:电子商务   类型:普通   作者:wjunxi   查看:379   回复:0   获赞:0   时间:2022-03-28 17:02:57
亲子关系鉴定案件中,经常遇到只有父亲或母亲一方参与的鉴定。在此类鉴定分析中,如果常用的20个常染色体STR位点中,有2个或以上不复合遗传规律,多数实验室会采取增加额外的试剂盒,以增加位点数目,或增加不同类型的位点(比如Y-STR或X-STR),来做进一步的分析。但这种传统的做法,不但耗时耗力,高通量测序公司还会增加额外的经济成本。

  今天,我们向您推荐一篇刚刚发表在《Forensic Science International:Genetics》上的文章——《Next generation sequencing:Improved resolution forpaternal/maternal duos analysis》,看看Illumina的新一代测序技术(NGS)如何帮法庭科学家解决这个棘手的问题。

  天津市公安局刑事科学技术研究所的匡金枝所长和马妍博士等学者,在4例单亲亲子鉴定案件中,发现使用CE系统20个常染色体STR位点分析,存在2个位点不复合遗传规律,为了证明这2个位点是突变产生、还是真正的排除位点,他们继续使用Illumina的法医专用MiSeq FGxTM系统,对样本进行进一步分析。

  这4对(8个)样本均来源于FTA血卡,匡所长和马妍博士的团队设计了一套平行的检测方案同时进行:

  1、使用3.2mm血卡的DNA提取液扩增进行文库构建

  2、使用1.2mm血卡直接扩增进行文库构建

  扩增制备好的样本使用MiSeq FGxTM进行测序,并使用ForenSeqTM UAS软件对测序结果进行分析,得出结论:

  1、使用FTA血卡直扩的结果与DNA提取液的结果,完全一致。

  2、除了先前在CE系统上发现的片段长度差异外,还发现了多个STR位点(包括常染色体、Y染色体和X染色体)的内部序列差异,同时在个体识别的SNPs位点中也发现了多个位点不复合遗传规律。

  3、排除了这4对样本间的父/母-子关系。

  同时,文章分析认为,相对于传统的CE平台解决方案,基于NGS技术的法医专用MiSeq FGxTM系统包含更多的信息位点,单次运行就可获得:27个常染色体STR位点24个Y-STR位点7个X-STR位点94个个体识别SNPs位点,但从位点数量上看,就已经是传统CE系统的7.3倍。并且该系统还拥有更成熟的软件分析系统,在获得每个STR位点的片段长度的同时,还获得了每个片段的碱基排列顺序。通过查看这些片段中碱基的排列顺序,可以进一步了解每个STR位点间的序列差异,这将大大提高特殊案件样本中每个STR位点的分辨率。在此类分析中使用这套流程,可最大限度的解决难题,而不需要运行多个试剂盒,既节省时间成本,又节省金钱成本。

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