较新的组学方法，如宏转录组学和代谢组学，宏转录组可对肠道微生物群和人类宿主之间的相互作用进行功能评估。为使这些方法生成有意义的数据，样本收集的方法是至关重要的。先前的研究依赖于昂贵和侵入性的样本采集方法，如肠道活检，而其他研究则依赖于更简单的采集方法，如粪便样本，这些样本不一定能完全代表与宿主接触的微生物。在这项初步研究中，研究人员试图尝试一种新颖的、微创的方法，对5名接受常规筛查结肠镜检查的健康参与者，使用粘膜细胞学刷样取样和肠道活检取样进行人体微生物采样。研究人员比较了两种收集方法之间的宏转录组学分析结果，发现两种方法之间的细胞学刷样中分类均匀性和β多样性增加，群落转录谱相似。代谢组学评估显示了两种方法之间的显著差异，这意味着细菌衍生的代谢物与人类吸收的代谢物存在差异。综上所述，本研究支持使用粘膜细胞学刷样取样的方法进行微生物组采样，但在进行代谢组学评估时必须谨慎。

　　推荐语：为产生有意义的代谢组和微生物组数据，样本收集的方法是至关重要的。本研究利用并比较了两种肠道组织采集的方法来评价代谢产物和微生物组，发现用刷子采集微生物组提供了有价值的数据。然而，对于代谢组学评估，仍然需要活检样本。