收藏文章 楼主
从Illumina MiniSeq™ 开始着手NGS
版块:电子商务   类型:普通   作者:wjunxi   查看:350   回复:0   获赞:0   时间:2022-03-28 15:57:33
如今,全世界都知道了Illumina的新款测序仪——MiniSeq,它是专为那些需要简单实惠、但功能强大的靶向测序方案的研究人员而设计的。不过,我试用这个小仪器已有几个月的时间,当时我加入了Illumina核心应用组。我的背景是普通生物学和公共卫生,尽管我曾经在科研和工业实验室担任研究助理,但我对新一代测序(NGS)没有任何经验。虽然掌握对工作很关键的技术和应用还存在挑战,但我能相对轻松地安排实验并运行。基因分析        从指导运行设置到数据分析的功能,自始至终,MiniSeq都在为我这样的NGS新手用户而考虑。

  我的职责之一是支持Illumina的文库制备产品,包括TruSeq从Illumina<wbr>MiniSeq™<wbr>开始着手NGS Targeted RNA,一种对几十至几千个基因同时进行表达谱分析的扩增子方法。在文库制备之后,我将在MiSeq从Illumina<wbr>MiniSeq™<wbr>开始着手NGS上测序我的文库,并在BaseSpace从Illumina<wbr>MiniSeq™<wbr>开始着手NGS上分析数据,MiSeq是近几年Illumina主力的桌上型测序系统。尽管MiSeq系统是用户友好的,但是当我开始使用MiniSeq时,我还是惊讶地发现了更多简单和有用的功能,它们来自MiSeq和NextSeq从Illumina<wbr>MiniSeq™<wbr>开始着手NGS系统的最佳创意组合。MiniSeq流动槽是干燥包装的,这节省了MiSeq流动槽因为液态运输所需的准备时间。MiniSeq一体化试剂盒的设计节省了实验所需的时间和空间。MiniSeq的进一步改进包括,试剂盒是全包的,含有全部洗涤液,因此不需要在每次运行时购买和识别不同的缓冲液和部件。同时,MiniSeq是Illumina台式测序系统中占地面积最小的,只有18 x 19英寸,将更多实验室台面上空间留给其他任务。

  MiniSeq运行所需的设置时间极少;最终的文库准备只需要不到10分钟。仪器设置简单至极,屏幕上一步一步的动画指引我完成上样试剂盒和流动槽的过程。经过一些系统检查,仪器就可以开始运行了。MiniSeq在大约24小时内即可完成2 x 150 bp的测序运行,使得计划第二天下一次运行更加容易。仪器还显示了运行大约在什么时候完成。

  当运行完成时,MiniSeq直接进入洗涤过程,像NextSeq一样,因此直到计划下一次运行才需要回到仪器边。MiniSeq系统也有在运行后自动将试剂盒中的所有试剂清理到废液瓶中的选项,协助安全处理用过的试剂盒。

  与Illumina其他的测序系统一样,MiniSeq与BaseSpace完全兼容。不过MiniSeq最棒的地方在于:此系统内置Illumina新的Local Run Manager软件。这个仪器上的软件追踪运行,并自动开展数据分析。我曾以为所有的NGS分析都绝对需要大型的计算机系统或BaseSpace这样的云端分析环境(你仍然可以使用这些来分析),但Local Run Manager不同–所有分析都在MiniSeq上自动完成。

  通过Local Run Manager来设置运行非常简单,可以通过标准的网页浏览器来操作。第一步是选择预先设定好的应用。Local Run Manager可以选择一个预定义的模板来作为你的模板,以方便设置所需的读长和样品索引,并输入样品信息。

 我 在下方展示

 
回复列表
默认   热门   正序   倒序

回复:从Illumina MiniSeq™ 开始着手NGS

暂无用户组
退出
等级:0级
学途币:
游客:

平台声明:

为打造一个高质量、高收录的外链平台,站长将针对所有普通用户投稿的内容进行审核,针对文章原创度、文章格式是否杂乱、外链数量是否泛滥等多个方面对投稿内容进行审核测评,只有满足条件的内容才会通过审核。

平台将持续严厉打击发布虚假不实信息内容,一经发现立即删除,且将对发布虚假内容的账号进行相应的处罚。

当用户等级达到2级及以上等级之后,可联系站长【QQ:724413399】免费升级至VIP会员组,将免费获得发贴免审核权限,以后发的帖子都将跳过审核直接发布成功!

Powered by HadSky 7.7.16

©2015 - 2024 seo学途论坛网

站内帖子均为用户自愿发表,并不代表本站立场~

XML( 1234 )

您的IP:3.147.103.227,2024-05-13 04:24:13,Processed in 0.01627 second(s).

网站备案号:黔ICP备19009860号-2

seo学途论坛网是一个可以免费发外链的论坛,大家可以免费发布含有纯文本外链、锚文本外链的精美软文内容,也可以在论坛中与大家进行交流、讨论更多话题。
头像

用户名:

粉丝数:

签名:

资料 关注 好友 消息
免责声明

1、本站资源,均来自网络,版权归原作者,所有资源和文章仅限用于学习和参考 。

2、不得用于商业或非法用途,否则,一切责任由该用户承担 !

3、本站内容如不慎侵犯了你的权益,敬请谅解,内容素材由网友自发上传并非本站意愿,您可参照文章侵权处理流程联系我方解决!


侵权删除请致信 E-Mail:724413399@qq.com