哈达尔海沟是海洋最深和最偏远的区域。由于峡谷深度采样的技术挑战,11公里深的 Challenger Deep是探索最少的。它接收来自上覆水柱的有机物质和重金属,这些水柱在其 V 形地形上以不同方式积累。在这里,研究者收集了Challenger深渊斜坡和底轴的沉积物,从而能够深入了解其原位微生物群落。从37个宏基因组中检索到的586个宏基因组组装基因组的分析显示,底轴和斜坡位点之间存在明显的多样性和代谢能力。宏基因组中 26% 的原核16S rDNA读数是新的,随着水和沉积物深度的增加而增加。这些主要异养的微生物可以回收大分子并利用简单和复杂的碳氢化合物作为碳源。宏基因组和宏转录组数据支持沉积物中砷的减少和生物转化以获得能量,这些沉积物中砷的积累比非深沟位置多两倍。宏基因组与斜坡位点相比,厌氧氨氧化的完整途径主要在从底轴沉积物中回收的基因组中确定。
推荐语:研究结果扩展了大家对深渊沉积物中微生物介导的元素循环的了解,并揭示了与沟渠中氮损失有关过程分布的差异。由此表明,Challenger Deep沉积物是微生物的大型储存库,它们有助于深海生物地球化学,并且可能被用于生物技术研究和应用。
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