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Illumina NGS技术或将成为PMI推断新方法
版块:电子商务   类型:普通   作者:wjunxi   查看:493   回复:0   获赞:0   时间:2022-03-28 16:55:39
PMI,Post Mortem Interval,死后间隔时间。PMI推断是法医学鉴定中需要解决的重要问题之一。这是因为许多非自然死亡的发生时间不清,而死亡时间在多数情况下标志着案件发生的时间,并与涉案的人和事密切相关。因此,推断死亡时间对确定发案时间,认定和排除嫌疑人有无作案时间,划定侦查范围乃至案件的最终侦破均具有重要作用。特别是案件涉及到多个嫌疑人时,死亡时间的准确推断尤显重要。二代测序平台目前主要依据死后尸体变化发生的规律粗略推断死亡时间。

  今天,我们向您推荐一篇今年发表在《Science》上的文章——《Microbial community assembly and metabolic function during mammalian corpse decomposition》(哺乳动物尸体分解过程中微生物群落的构建与代谢功能)。

  Metcalf教授等人使用高通量测序技术(Illumina Hiseq,Miseq平台),对古菌和细菌群落的16S rRNA、真核微生物群落的18S rRNA,以及真菌群落的内转录间隔区(ITS)进行测序分析,描述了在尸体分解过程中,相关微生物群落多样性的变化。

  大型哺乳动物死亡后,尸体会成为微生物的丰富食物来源。无论土壤的类型,季节,以及种属,在腐烂过程中的微生物群落的演化可以作为衡量死亡时间的手段。而且,尸体的“养分”,可以供给土壤和昆虫相关的真菌或细菌繁殖。这些微生物代谢“专家”,可将蛋白质和脂类代谢为恶臭的化合物如尸胺、腐胺、和氨。即使尸体被移走,这些微生物的标记,也可能在土壤中存在存在很长时间。

  这些数据,都可以在在时间及空间上为PMI及死亡位置提供证据支持,也为后续法医调查提供了理论基础。

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